CaPSID

Скріншот програми:
CaPSID
Дані програми:
Версія: 1.4.3
Дата завантаження: 20 Feb 15
Розробник: Shane Wilson
Ліцензія: Безкоштовно
Популярність: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

капсида є всеосяжним платформи з відкритим кодом, який об'єднує в собі високу продуктивність обчислень трубопроводу для ідентифікації послідовності патогена і NBSP; і характеристика людських геномів і transcriptomes разом з масштабованої базі даних результатів і для користувачів веб-додатки на основі програмного забезпечення для управління, запитуючи і візуалізації результатів.
Початок роботи
Ви будете потребувати в базу даних MongoDB, пітон 2.6+ установку і Apache Tomcat 6 +. Для отримання більш детальної інформації ознайомтесь з вікі:
http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

What новий У цьому випуску:

  • Виправлення Повідомлення про помилку при запуску віднімання і вирівнювання не найден
  • Детальніше робота з фіксації тривалих запитів

Що нового у версії 1.4.2:

  • Видаляє MongoKit залежність

Що нового у версії 1.4.1:

  • Тайм-аут курсор Виправлення для довгих Running Статистика запитів

Що нового у версії 1.4.0:

  • Статистика Додає час їх виконання, а не всі Наприкінці
  • Зберігає унікальний ідентифікатор для генів, як UID

Що нового у версії 1.2.7:

  • Виправлена ​​README

Що нового у версії 1.2.6:

  • Віднімання відфільтровує невідображення при побудові відображається читає

Що нового у версії 1.2:

  • Утиліта для створення FastQ файли з невідображення читає
  • , щоб повернутися перетин FastQ файлів
  • , щоб повернутися фільтр FastQ файли
  • Додана mapq поріг прапор віднімання
  • Gbloader тепер можуть завантажити бактерії та грибкові геноми
  • Зберігає геномних послідовностей в базі даних, використовуючи GridFS
  • Зниження обсягу пам'яті при розрахунку статистичних даних
  • Використання подпроцессов замість os.system
  • забиває mapq фільтр повинен включати 0

Що нового у версії 1.1:

  • Додана підтримка для пари кінець читає

Що нового у версії 1.0.1:

  • Додана підтримка для аутентифікації MongoDB

Вимоги

  • Python

Схожі програми

Geant4
Geant4

20 Feb 15

RFLP planner
RFLP planner

3 Jun 15

TRMiner
TRMiner

14 Apr 15

tapir
tapir

11 May 15

CaPSID

Коментар не знайдено
додати коментар
Включіть картинки!
Пошук за категоріями