Bibliosphere Analysis Kit

Бібліосфера пропонує унікальне поєднання літератури видобутку та аналізу шляхів для молекулярних біологів, які цікавляться регуляції генів і біологічних мережах.
 Бібліосфера Шлях видання використовує велику базу даних окремо, змодельованих відносин між генами, білками, комплекси, клітин і тканин разом з до сучасних текстових гірничої техніки для автоматизованого вилучення знань, щоб дозволити вам зв'язати ваші дані для біологічних мереж в різних біологічних контекстах.
 Використовуйте Бібліосфера до

• розширити біологічних мереж за канонічної інформації шляху (нормативна та метаболічний)
• об'єднати ваші високі результати продуктивності при роботі з біологічних знань і послідовності аналіз, заснований
• виконати контекстно- чутливі Аналіз регулятивного шлях
• генерують експеримент конкретних варіантів стежка
• посилання шляху до механізмів хвороби і генів
• зробити розширений дослідно-конструкторських

Що нового У цьому випуску:

Нові та вдосконалені джерела даних

• Genomatix Експерт Куратор Джин-Джин Стосунки:
   Genomatix інтегрувала власну базу знань експертних Куратор даних по регуляції генів в Бібліосфера. Це унікальне джерело даних додає семантику ген-генних відносин з динамічно генеруються Бібліосфера генних мереж, надання інформації, як "Джин активує транскрипцію гена B" або "Джин фізично взаємодіє з геном B".
  
• сигнальних шляхів:
   Частини Джин Онтологія, що мають відношення до передачі сигналу, а також дані, зібрані з літератури були об'єднані для забезпечення можливості виявлення канонічних шляхів, пов'язаних з цілеспрямованим мережі.
  
• метаболічний шлях асоціацій:
   Метаболічні асоціації стежка були інтегровані функції, що дозволяють ідентифікувати метаболічних подій, що мають відношення до вашої набором генів.
  

• Шлях Подивитися з експертом куратором ген-ген відносини
   Груп генів складаються в легко зрозумілих динамічних мережевих графіків, що поєднують руки Куратор ген-генних відносини з даними, отриманими від автоматичного вилучення знань. Мережі можуть бути налаштовані за допомогою фільтрів і зосередився в гені центру спосіб виконання найкоротший аналіз шляху.
  
• Клітинна локалізація Подивитися
   На підставі GO Анотації генів відносяться до їх внутрішньоклітинної локалізації та візуалізується у вигляді показаної компоновки клітин, що дозволяє визначити субклітинні регіонів і відділень відношення до вашої генів набору.
  

• Управління проектами: Управління аналізу шляхом організації їх у папки проекту. Швидкий доступ попередні результати за допомогою декількох клацань миші або додати нові пошуки, щоб існуючі проекти.
  

• Різні дрібні поліпшення і виправлення

Вимоги

• Mac OS X 10.2 або вище
• Java 1.4.1 (оновлення 1 рекомендується)
• підключення до інтернету
• оцінка аккаунт Genomatix (безкоштовно)