Topographica

Topographica являє собою пакет програмного забезпечення для комп'ютерного моделювання нейронних карт.
Об'єкт, щоб допомогти вченим зрозуміти функції мозку на рівні топографічних карт, які складають сенсорні і моторні системи.
Topographica покликаний доповнити багато хороших низького рівня нейронів тренажери, які доступні, такі як Genesis і Нейрон. Ці тренажери зосередитися на моделюванні детальну внутрішнє поведінку нейронів і дрібних мереж них.
Topographica замість цього фокусується на великомасштабної структури і функції, які видно тільки тоді, коли багато тисяч таких нейронів з'єднані в топографічних карт, що містять мільйони з'єднань.
Багато важливих явища не можуть бути вивчені без таких великих мереж, у тому числі двовимірної організації візуальної орієнтації та карти напрямок руху, і об'єкт сегментації і угруповання процесів.
Для того, щоб такі моделі практичні, в Topographica фундаментальна одиниця являє собою лист нейронів, а не нейрона або частини нейрона.
Для більшості моделювання, листи можуть бути реалізовані на високому рівні, що складається з абстрактного вогню-ставки або інтегративно-порогових нейронів.
При необхідності для перевірки або для конкретних явищ, Topographica може бути легко розширений за допомогою листа, який взаємодіє з більш детальних моделей нейронних в інших тренажерів.
Менш докладно листів можуть бути також використані тимчасово, наприклад, при взаємодії з моделлю в режимі реального часу.
Протягом усього Topographica робить його простим у використанні відповідного рівня деталізації та складності, як визначено за наявною обчислювальної потужності, явищ, що представляють інтерес, і кількість біологічних даних, доступних для перевірки.
На малюнку в правому верхньому куті показує приклад Topographica модель ранніх стадіях в зоровій системі, моделювання, як сітківки вхід перетворюється таламуса, первинної зорової кори, і вищих кіркових областях. Тому Topographica є загального призначення Карта симулятор, він також підтримує будь-який інший сенсорної модальності, яка організована в топографічних картах, таких як дотику і слуху, а також моторних областях.
Topographica знаходиться у вільному доступі для скачування, і є проектом з відкритим вихідним кодом, чиї можливості можуть бути розширені і змінені будь-яким користувачем. Ми вітаємо внесок від користувачів, і запрошуємо зацікавлених людей приєднатися до нашої команди в глобальному масштабі розподіленої розробки.
Незважаючи на те, що код і раніше в дуже активному розвитку, це в повсякденному використанні в численних науково-дослідних проектів та академічних занять.
Враховуючи швидкий темп сучасного розвитку, будучи розробником, ймовірно, кращий спосіб йти в ногу з усіма змінами.