MacMolPlt є інструментом візуалізації хімії, які можуть бути використані для створення молекули з інтегрованим графічним Model Builder, створювати вхідні файли для обчислювальної програми хімії GAMESS, а потім візуалізувати результати обчислювальних трас хімії. Особливості включають в себе високу якість 3D-дисплей, анімацію нормальних режимів і послідовності реакцій і вихід до різних форматах, включаючи зображення високої якості і QuickTime і Flash-фільмів.
- Введення з допомогою:
- Формат MolPlt файл вирубали GAMESS
- вставляючи в декартових координатах з будь-якого GAMESS або Gaussian лог-файл
- будь GAMESS вхід, увійдіть або IRC файл
- Xmol стиль XYZ файл
- Файли формату Molden
- Білок Банк даних (PDB файл)
- Хімічна Markup Language (CML) Файли
- Build графічно за допомогою редактора інтерактивної молекули
- Build з використанням декартовій або Z-матриця стиль внутрішні координати вручну
- 3D-дисплей структури і звичайний режим
- Анімація нормальних режимах.
- 3D обертання в режимі реального часу і переклад під контролем миші
- Розрахунок будь-якого параметра Z-матриці
- Візуально міра / відображати відстані, кути і двогранних кутів.
- Автоматичне створення лінійних найменшого руху (LLM) шляхами
- 2D і 3D обчислення і відображення
- що молекулярні орбіталі (Ао, МО, або ЖЗО)
- повна електронна щільність
- відмінностей у щільності
- Молекулярна електростатичних потенціалів (MEPMaps)
- Основні вхідного файлу генератор для GAMESS
- OpenGL використовується для високоякісної 3D-рендеринга
- Підтримка молекулярної симетрії
- Створити симетрії залежні атоми
- Визначити симетрії унікальні атомів
- Автоматично визначає перелік підтримуваних точкових груп для набору координат.
- Повернути координати у відповідний принцип орієнтації
- оператори Показати симетрії для багатьох точкових груп
- якість своєї продукції Публікація (кольорова або чорно-біла) за допомогою Прямий друк або скопіювати і вставити в інший додаток.
- Вихід в різних формах, включаючи Windows Bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, флеш-роликів і QuickTime фільмів.
Що нового У цьому випуску:
Деякі поліпшення були зроблені до коду відображення. Опції були додані до 3D панелі prefernces для плавного затінення з і без тіней.
Додано елементарний підтримку Mopac файлів.
Додана можливість перемикання видимості неемпіричних, MM, і атомів EFP.
Покращена підтримка базової моделі потенціалів.
Додано гачок у вхідному будівельника для нової програми GAMESSQ.
Поліпшена PDB файл аналізатора.
Коментар не знайдено