Open Babel

Скріншот програми:
Open Babel
Дані програми:
Версія: 2.3.2
Дата завантаження: 17 Feb 15
Розробник: Geoff Hutchison
Ліцензія: Безкоштовно
Популярність: 58

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

Відкрити Бабель з відкритим вихідним кодом, спільні, безкоштовно і мультиплатформенна бібліотека програмного забезпечення, який був розроблений, щоб діяти в якості хімічного інструментів спеціально спроектований, щоб визнати численні мови хімічних даних. Це просто назву і ldquo; Open Хімія Toolkit і rdquo ;. Основні особливості glanceWith відкритого Бабеля, користувачі зможуть шукати, аналізувати, перетворювати і зберігати дані з хімії, молекулярного моделювання, біохімії, а також в інших суміжних областях. Він підтримує широкий спектр поширених форматів хімічної файлів, у тому числі Mol2, SDF / моль, PDB, XYZ, посміхається і ХМЛ.
Крім того, Open Babel забезпечує підтримку інструментарій, хімічна MIME повнофункціональний програміста, СМАРТС Шукач, гнучкий атом / Typer облігацій, видалення водню і додавання, bitvector клас, матричні і векторні перетворення, а також молекулярної тест suite.Under капот і Операційні systemsOpen Бабель повністю написана в мові програмування С ++. Це і Rsquo; са True Software крос-платформний, який підтримує GNU / Linux, BSD, Solaris, SGI, Microsoft Windows і операційних систем Mac OS X. Обидва 32-бітних і 64-розрядних комп'ютерів офіційно підтримується на момент написання this.Getting розпочався з відкритого BabelFirst все, ми настійно рекомендуємо вам встановити Open Babel за допомогою попередньо зібраних бінарних пакетів з програмного забезпечення за замовчуванням Сховища ваш розподіл Linux. Якщо ваша система GNU / Linux Байдуже & Rsquo; т мати програмне забезпечення Open Babel у своїх РЕПО, то ви і Rsquo; доведеться скомпілювати і установка програми з використанням універсальних архівних джерел, доступних на Softoware.
Завантажити архів (tar.gz архів), розпакувати його на місці за вашим вибором, відкрийте емулятор терміналу, перейдіть до витягнутого папки і виконати & ldquo ;. Cmake & rdquo; Команда (без лапок), щоб налаштувати проект. Потім необхідно запустити і ldquo; зробити і rdquo; Команда, без лапок, звичайно, скомпілювати його. Будь ласка, переконайтеся, що інструмент CMake у встановлений в операційній системі до початку вищевказаної інструкції

Що нового У цьому випуску :.

  • Цей реліз являє собою великий баг-фікса-реліз і повинні бути стабільними оновлення, настійно рекомендується для всіх користувачів відкритого Бабеля. Багато помилок і удосконалення, які були додані в минулому році з моменту випуску 2.3.0.

Що нового у версії 2.2.2:

  • Цей реліз представляє собою великий реліз помилка скрутного становища і є стабільним оновлення, настійно рекомендується для всіх користувачів відкритого Бабеля. Хоча там не може бути багато нових можливостей, багато аварій та інші помилки були виправлені, так як 2.2.1.
  • Оновлення до нової InChI 1,02 релізі виробляти стандартизовану Inchi і InChIKey вихід.
  • Виправлено безліч помилок стереохімії при читанні / запису посмішки. Це є частиною більш великого проекту, який буде закінчений у версії 2.3.
  • Виправлена ​​компіляція та встановлення на Cygwin і MinGW платформ.
  • Значно поліпшена ароматичности і Кекуле призначення зв'язок.
  • Покращена 2D - і GT; 3D координацію виробництва
  • Поліпшення координації покоління з використанням --gen3d операцію командного рядка
  • Покращена продуктивність координацію виробництва.
  • New --fillUC операція командного рядка для Бабеля.
  • Виправлення рН-залежною водню додатково.
  • Додана підтримка для читання вібраційні дані з Molden, Molpro і NWChem вихідних файлів.
  • Оновлене атомних радіусів від недавніх теоретичних розрахунків.
  • Виправлена ​​помилка при читанні GZIP-стислих Mol2 або XML файли.
  • закривати файли після помилки. Виправлена ​​помилка з Pybel, де файли будуть залишатися відкритими.
  • Багато виправлень більш помилок і невеликих поліпшень функцію. == Нові формати файлів == Імпорт та експорт:
  • Molpro вхід і вихід.
  • VASP файлів координат (CONTCAR і POSCAR).

Що нового у версії 2.2.1:

  • Поліпшення інтерфейси сценаріїв, в тому числі Python 3 підтримки та поліпшення Java і C # підтримку.
  • Додана підтримка MACCS відбитків пальців. Завдяки проекту RDKit.
  • Багато виправлень і поліпшень в коді силового поля. Зокрема, реалізація ФФУ силове поле повинен обробляти набагато більше молекул.
  • Покращена 3D координацію виробництва, зокрема, з фрагментами кільця. Ви можете дати цьому спробу з obgen корисності.
  • Виправлена ​​різноманітність PDB помилок імпортним типів атомів.
  • Додана підтримка для читання звинувачення і радіусів від форматів PQR файлів.
  • Додана підтримка для читання і написання модульних осередків в PDB форматів.
  • New & Quot; вихід & Quot; Формат файлу для прийняття загального та Quot; .out і Quot;, & Quot; .log і Quot;, і & Quot; .dat і Quot; файли і читати з відповідним типом файлу на основі вмісту. В даний час працює дуже добре для квантових пакетів хімії.
  • Додана покращена обробка помилок і звітність, коли не вдається завантажити формати файлів.
  • Покращена підтримка формату файлу CIF.
  • Багато, багато, багато додаткових виправлень і невеликих поліпшень.

Схожі програми

PyVib2
PyVib2

2 Jun 15

GChemPaint
GChemPaint

2 Jun 15

JChemPaint
JChemPaint

2 Jun 15

chemlab
chemlab

14 Apr 15

Інші програми розробника Geoff Hutchison

Avogadro2
Avogadro2

22 Nov 14

ChemSpotlight
ChemSpotlight

13 Dec 14

Open Babel

Коментар не знайдено
додати коментар
Включіть картинки!
Пошук за категоріями