Arabidopsis Motif Сканер (AMS) являє собою додаток для Windows, який працює на локальних комп'ютерах. Вона була розроблена для створення генних мереж шляхом виявлення позицій цис-регуляторних елементів в арабідопсис модель заводу і надаючи простий інтерфейс для визначення і оцінки генних відносин. Її основна інноваційна особливість полягає в об'єднанні позицій елементів цис-регуляторних, NGS і ДНК Chip Масиви експресії даних, Arabidopsis анотаціями та взаємодія генів для ідентифікації генних мереж, регульованих факторів транскрипції. У дослідженнях, орієнтованих на функції транскрипційних факторів, програмне забезпечення використовує дані експресії і зв'язують мотиви сайту в регулятивних регіонах генів передбачити прямі гени-мішені. Крім того, AMS використовує ДНК-білок і взаємодія proteinprotein дані для полегшення ідентифікації метаболічних шляхів, регульованих фактора транскрипції інтересів.
Коментар не знайдено