Gabedit

Gabedit це графічний інтерфейс користувача до гаусом, Molcas, Molpro і MPQC обчислювальна хімія пакетів.
 
 Gabedit включає в себе графічне кошти для генерації ключових слів і варіантів, специфікації молекули і þér вхідні секції для самих передових видів розрахунку Gabedit включає розширений Molecule Builder.
 
 Ви можете використовувати його, щоб швидко малювати в молекулах і вивчити їх у трьох вимірах. Ви можете побудувати молекули від атома, кільця, групи, амінокислоти і нуклеозида. Ви також можете прочитати геометрії з файлу. Більшість великих форматів молекулярної файлів підтримуються.
 
 Gabedit включає в себе вікно Setup Розрахунок Gaussian, Molcas, Molpro і MPQC, яка дозволяє налаштувати гауссових, Molcas, Molpro і MPQC робочих місць в простій і зрозумілій формі.
 
 Gabedit включає в себе текстовий редактор для редагування Molcas, Molpro, Гаусса та MPQC вхідних файлів.
 
 Gabedit можна графічно відобразити різні Гаусса, Molcas, Molpro, MPQC і (частково) результатів розрахунку АПД, в тому числі такі:
 
 ย ท Молекулярні орбіталі.
 ย ท поверхонь від електронної щільності, електростатичного потенціалу, ЯМР щільності екрануючої та інших властивостей.
 ย ท Поверхні можуть бути відображені в твердих, прозорих і сітчастих дротовому режимах.
 ย ท Поверхні можуть бути пофарбовані в роздільній власності.
 ย ท Контури (colorcoded).
 ย ท Літаки (colorcoded).
 ย ท Диполь
 ย ท осі XYZ і головні осі молекули.
 ย ท Анімація нормальних режимах, відповідних коливальних частот.
 ย ท Анімація обертання геометрії, поверхні, диполя, XYZ та головних осей молекули.
 ย ท Анімація контурів.
 ย ท Анімація colorcoded літаків.
 
 Gabedit може відображати ІК і КР спектри обчислюються. Gabedit може генерувати POVRAY файл геометрії (атомів + облігацій, у тому числі облігації водню в), поверхонь (у тому числі colorcoded поверхонь), контури, colorcoded літаків.
 
 Gabedit може врятувати картину в PPM, BMP, JPEG (формат) і PS. Gabedit може автоматично генерувати серію фотографій для анімації (вібрації, геометрії зближення, обертання, контури, colorcoded літаків)

Що нового У цьому випуску:

• Невеликі помилки були виправлені.
• NWChem тепер підтримується.
• Місцеві Вікна гри тепер підтримується.

Що нового у версії 2.3.5 :.

• Невеликі помилки були виправлені
• Атоми можуть бути встановлені під час моделювання молекулярної динаміки.
• Міграція з Каїра в OpenGL для малювання вікно геометрії.
• Міграція з gtkglarea в GtkGLExt.
• розпаралелювання за допомогою OpenMP.

Що нового у версії 2.3.0 :.

• Невеликі помилки були виправлені
• користувач може читати орбіталі, геометрію і нормальні режими від fchk Гаусса файлу.
• можна прочитати орбіталі від нового формату файлу MOPAC AUX (у тому числі стислому форматі).
• Кілька нових опцій в графіку XY і ContoursPlot вікон (Вставити текст, лінії, стрілки, зображення, нові теми ...).
• Довжини зв'язків можуть бути встановлені під час моделювання MD.
• Часткова оптимізація тепер можна з потенціалом ММ.
• Реалізація інструменту для прогнозування маси і великої кількості ізотопів для даної молекули. Реалізація інструменту для розрахунку електрофільні, нуклеофільниє і радикальні сприйнятливість до молекули.

Що нового у версії 2.2.0:

• Невеликі помилки були виправлені
• Все геометричні зміни можуть бути скасовані і заново, використовуючи Undo і Redo (U / U або Ctrl Z / Ctrl у)
• користувач має повний контроль над відображаються на кресленні облігацій.
• рисунок атома молекули атома були спрощені.
• рисунок фрагмента молекули фрагмента були спрощені.
• Gabedit прочитати зв'язності з Gabedit, хин, PDB, mol2 і моль файлів.
• користувач може встановити значення відстані, кута зв'язку і двогранного кута.
• молекулярної динаміки конформаційних Пошук реалізований з використанням потенціалу мм (Amber 99).
• Молекулярна динаміка конформаційних Пошук реалізований з використанням напівемпіричних методів (з відкритих MOPAC або PCGamess).
• Міграція з функцій малювання GDK в Каїр :. Хреста-пристрої рендеринга для векторної графіки
• Каїр в даний час використовується для графіка XY Gabedit віджета (використовується Gabedit за нічию спектрів).
• Каїр в даний час використовується для графічної геометрії.
• Геометрія можуть бути експортовані в EPS, PS, PDF або SVG файл.
• Криві вікна графіка XY можна експортувати в EPS, PS, PDF або SVG файл.
• Новий інструмент для обчислень відстані між 2 точками на вікні графіка XY. & Quot; кнопку перемикання і Quot Ctrl +; може бути використаний для робити зум на вікні графіка XY.
• Нова версія PCGamess (світлячок) тепер підтримується

Що нового у версії 2.1.13:

• Невеликі помилки були фікс
• молекулярної динаміки конформаційних Пошук реалізований з використанням потенціалу мм (Amber 99).
• Молекулярна динаміка конформаційних Пошук реалізований з використанням напівемпіричних потенціал (використовуючи MOPAC або PCGAMESS).
• можна оптимізувати геометрію в інтерактивному режимі з використанням методу MOPAC або PCGamess напівемпіричну, від геометрії вікна Draw
• Міграція з функцій малювання GDK в Каїр: Крос-пристрої рендеринга для векторної графіки. Каїр в даний час використовується для графіка XY Gabedit віджета (використовується Gabedit за нічию спектрів). Каїр в даний час використовується для графічної геометрії.
• Геометрія можуть бути експортовані в EPS, PS, PDF або SVG файл. Криві вікна графіка XY можна експортувати в EPS, PS, PDF або SVG файл.
• Новий інструмент для обчислень відстані між 2 точками на вікні графіка XY. & Quot; Ctrl + ліва кнопка & Quot; може бути використаний для робити зум на вікні графіка XY.
• Нова версія PC GAMESS / Firefly тепер підтримується

Вимоги

• GTK +