InterMine

InterMine надає процедури доступу до datawarehouses на основі технології InterMine.
InterMine є потужним відкритим вихідним кодом система сховища даних. Використання InterMine, ви можете створити бази даних біологічних даних, доступ до яких складних інструментів веб-запиту. Аналізатори призначені для інтеграції даних з декількох поширених біологічних форматах і є основа для додавання ваших власних даних. InterMine має привабливий, зручний веб-інтерфейс, який працює "з коробки" і можуть бути легко налаштовані для ваших конкретних потреб.
Всі InterMine код вільно доступний під ліцензією LGPL

Що нового У цьому випуску :.

• Зв'язок і InterMine:
• Є кілька нових способів посилаються на ваш шахти. Дивись Посилання для докладної інформації.
• формати JSON веб-служби:
• Є ряд нових результатів WebService формати. Приєднання jsonobjects, які з'явилися в 0,95, тепер у нас є формати JSON для досить багато всього іншого:
• Результати:
• jsonrows - табличне представлення даних з додатковими мета-даних
• & Quot; jsontable і Quot; . - Формат контейнера для побудови вбудованих шаблони (див вкладення підручник)
• & Quot; Кількість і Quot; і & Quot; jsoncount і Quot; - Формати для просто приймає Граф запиту
• веб-сервісу мета-даних (Модель і шаблонів)
• & Quot; JSON і Quot; - Легко, оформленої версії моделі даних і список доступних шаблонів
• Аутентификация в даний час працює в Perl веб-сервісу Клієнт:
• Люди клієнта Perl веб-сервісу тепер мають програмний доступ до своїх списками і приватних шаблонів. Просто надайте ваші реєстраційні дані для клієнта увійти в свій аккаунт (ваші дані передаються в зашифрованому вигляді). Ця функція буде працювати з усіма шахт з веб-сервісів, а не тільки тих осіб, які 0,96 і вище.
• Результати об'єкт з веб-сервісу клієнти:
• Клієнти Perl і Java мають можливість отримати результати назад в якості об'єктів (JSON об'єкти, або в Perl, завищені до повної об'єктів результат). Це спрощує деякі складні питання обробки даних, і справа з зовнішніх з'єднань і колекції.
• Вбудовані Таблиці:
• Тепер Ви можете спочатку вставляти таблиці даних з будь-якої міни з опорної веб-сервісу в ваших веб-сторінок з JavaScript і CSS. См вкладення підручник для демонстрації та введення до цієї техніки. Будьте впевнені, щоб пограти з новою бібліотекою JavaScript доступні на http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Реєстр:
• Ми запустили центральну реєстраційної служби по реалізації InterMine. Це дозволить не тільки служити як & Quot; жовто-сторінок і Quot;, що дозволяє відвідувачам відкрити для себе нові джерела даних і полегшення взаємодії між як самих шахтах, але також підтримує веб-сервіси, надаючи реєстр веб-сервісу адреси та версій. Відвідайте до реєстру на http://www.intermine.org/registry, і за допомогу в реєстрації свій власний рудник, відвідайте RegisteringYourMine.
• посилання перенаправляє:
• Ви можете додати властивість є посилання в результатах перенаправлення на будь URL. См LinkRedirects для отримання додаткової інформації.

Зміст
• Головна сторінка:
• домашня сторінка InterMine тепер можна налаштувати для відображення різної інформації залежно від того чи ні користувач є новим. См HomepageConfig інструкції про те, як налаштувати цю поведінку.
• Новий тег:
• Ми додали новий тег: IM: Admin. Якщо ви помітити шаблон їм: Admin, він не буде відображатися у вашому веб-додаток. Це корисно для приховування шаблони, необхідні веб-сервіси InterMine від ваших користувачів. См мічення список всіх доступних тегів.
• Список завантаження:
• Процес завантаження списку була покращена.
• Інші зміни:
• ОНОВЛЕННЯ - більш суворий корекція кілька перевірка гіпотез по збагаченню віджетів. І Quot; Кількість тестів і Quot; Зараз кількість термінів, пов'язаних з еталонним списку.
• ОНОВЛЕННЯ - більш корисні опції фільтра зі збагачення віджетів
• NEW - Холм-Бонферроні додана опція для збагачення віджетів
• UPDATE - новий і Quot; видаляти і Quot; кнопка на сторінці списків
• Оновлення - взаємодії Displayer завантажується через AJAX, так сторінкову доповідь завантажується швидше
• FIX - і Quot; оцінка та Quot; Зображення невірного відображення в результатах пошуку
• ОНОВЛЕННЯ - QueryBuilder більш інтерактивним, вибравши пункт у списку буде прийняти вас назад до первісного пункту після оновлення сторінки / перезавантажувати
• ОНОВЛЕННЯ - Посилання додана до резюме колонки в результатах запиту, роблячи простіше для перегляду різних значень
• FIX - Ввійти помилка щодо змішаних випадків імена користувачів
• FIX - віджет помилка при перегляді після експорту даних віджетів
• NEW - запити шаблонів відсортовані за популярністю, якщо ви не ввійшли в систему, і в цьому випадку вони сортуються за датою кожен запит був останній запуск
• FIX - дані не повторюються в & Quot; інші та Quot; розділ на сторінках звіту
• FIX - шаблони правильно відображаються на сторінці звіту навіть для підкласів
• FIX - шаблони правильно візуалізації на аспект сторінок
• ОНОВЛЕННЯ - оновлення BioGRID конвертер для обробки змін в нові файли даних
• FIX - різні і Quot; золото & Quot; Тема CSS і зображення удосконалюються і оновлюються
• FIX - різьблення питання безпеки розглядаються в шаблоні відстеження
• ОНОВЛЕННЯ - стіл віджети можна згрупувати атрибутом, а також клас

Вимоги

• Python