MultiDendrograms

MultiDendrograms є простою, але потужна програма, щоб зробити ієрархічна кластеризація реальних даних, розподілених по ліцензії з відкритим вихідним кодом і NBSP ;. Починаючи з відстані (або терезів) матриці, MultiDendrograms обчислює його Дендрограмма використовуючи найзагальніші алгоритми агломераційних ієрархічної кластеризації , дозволяє настройку багатьох графічних параметрів уявлення, і результати можуть бути легко експортовані в файл. Коротка характеристика:
- Мультиплатформовий: розроблено в Java, працює у всіх операційних системах (наприклад, Windows, Linux і MacOS).
- Графічний інтерфейс користувача: вибірка даних, ієрархічні варіанти кластеризації, параметри уявлення дендрограмма, навігація по дендрограмі, відхилення заходи.
- Ієрархічні алгоритми кластеризації, реалізовані: змінна-група одиночній зв'язку, повна зв'язок, незважене середнє, середньозважена, невиважені центроїдного, зважена центроїдного і Об'єднаної між-в.
- Параметри: розмір Представницькі, орієнтація, етикетки, вісь, і т.д.
- Відхилення заходи: Cophenetic коефіцієнт кореляції, нормований середньоквадратичної помилки і нормовані середня абсолютна помилка.
- Експорт: ультраметріческое матриця, деталі Дендрограмма в тексті і Newick форматів дерев.
- Ділянка: дендрограмма зображення в JPG, PNG і EPS форматах.
MultiDendrograms реалізує змінної група алгоритмів, щоб вирішити проблему, не унікальність знайдений в стандартних алгоритмів пара-групи і реалізацій. Ця проблема виникає, коли два або більше мінімальні відстані між різними кластерами рівні у процесі амальгамування. Стандартний підхід полягає у виборі пари, порушення зв'язку між відстанями, і протікає таким же чином, поки не буде отриманий кінцевий ієрархічної класифікації. Тим не менш, різні кластеризації можливі залежно від критерію, щоб розірвати зв'язки (зазвичай пара просто вибрали навмання!).
Група алгоритми змінної групи більше двох кластерів, в той же час, коли відбуваються зв'язку, що викликали графічне представлення називається multidendrogram. Їх основні властивості:
- Коли немає зв'язку, алгоритми змінної групи дають однакові результати, як і пара-групи тех.
- Вони завжди дають однозначно визначається рішення.
- У поданні multidendrogram за результати можна явно спостерігати виникнення зв'язків протягом агломераційного процесу. Крім того, висота будь-якого інтервалу плавлення (смуги в програмі) вказує на ступінь неоднорідності всередині відповідного кластера

Вимоги :.

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment