РЕР проект програмне командного рядка, яка може бути використана для пошуку і ранжувати білки ссавців / гени, які спеціально і суттєво взаємодіючі зі списком білків / генів в контексті фонового signalome ссавців і інтерактомних мереж.
Входи в програмі () список насіння людини генних символів Entrez генів, (б) фонова мережі у форматі SIG, і (в) ім'я для вихідного файлу (веб-сторінки ім'я файлу з розширенням HTM ). SIGINT виводить впорядкований список генів / білків, які взаємодіють з компонентами зі списку насіння. Ці компоненти упорядковано Z-бал, який вимірює специфічність цих проміжних компонентів взаємодіяти з генами білків / зі списку насіння.
РЕР може працювати в операційних системах Linux, Mac і Windows, і вимагає фону мережі текстовий файл у форматі SIG.
Використання:
Розпакуйте архів
CHMOD + х sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
Коментар не знайдено