ZOOM Lite є відображення послідовності даних і візуалізації програмного забезпечення нового покоління. Вхідні Люди посилання геноми і Illumina / Solexa короткий читає файли або АВ Solid Color простір читає файли в різних форматах, таких як * .fasta * .fastq * _seq.txt * .csfasta т.д. ZOOM виводить результати зіставлення цих короткострокових зчитує на еталонній послідовності. ZOOM Lite має швидке і точне відображення ядро на основі нещодавно розробленої теорії декілька рознесені насіння. І один кінець і в парі кінець читає різної довжини від 15bp до 240bp можуть бути оброблені. Будь-яке кількість розбіжностей і один вставки / видалення різних довжин між прочитаним і його цільової області на еталонній послідовності допускається. Унікально відображені результати або кращі (Top N) результати для кожного читання буде повідомлено у відповідності з мінімальними невідповідності і довжиною INDEL. Оцінки якості використовуються для підвищення точності відображення. Грунтуючись на ядрі відображення, ZOOM Lite дозволяє користувачам завантажувати локальні дані і зчитування даних еталонної послідовності, виберіть правильні параметри, дані процесу велику кількість паралельно між чотирьох процесорів, контролювати запущені завдання, зберігати результати відображення, перегляду графіки результати картування і результати виведення відображення в будь-якому * .BED або формати * .GFF файл для подальшого обстеження з інформацією браузеру відстежувати УСК. Результати перетворення можуть бути переглянуті в будь-якому бажаному масштабі, з глибини читання графа над всією хромосоми до докладної вирівнювання послідовностей між читає і еталонна послідовність. Люди легко орієнтуватися в регіонах, що представляють інтерес просто за допомогою миші і перетягнути або прокрутки. ZOOM Lite є похідною від програмного забезпечення ZOOM студії
Що нового У цьому випуску :.
Версія 1.5 включає в себе SAM формат експорту, архітектура настройки, оптимізації коду краще, менше Програма двійковий розмір, і підвищений dabase engining для кращої продуктивності.
Коментар не знайдено