MISO (суміш изоформ) є ймовірнісної рамки написано в Python, що quantitates рівень експресії & NBSP; з альтернативного сплайсингу генів з РНК-Seq даних, і визначає диференційно регульованих ізоформи або екзонів за зразками.
Шляхом моделювання генеративної процес, який зчитує виготовляються з изоформ в Секвенирование РНК, модель MISO використовує байесовский висновок, щоб обчислити вірогідність того, що для читання виник з конкретної ізоформи.
MISO використовує виведений призначення читає изоформ для кількісного визначення великої кількості основного набору альтернативних ізоформ мРНК. Довірчі інтервали більш оцінки можуть бути отримані, які кількісно надійності оцінок.
Будь ласка, див http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ для MISO керівництві та документації
Вимоги :.
- Python
Коментар не знайдено