QuasiRecomb

QuasiRecomb є невеликий додаток, що запускається в командному консолі, імітуючи модель Маркова для генерації вірусних квазівидів. Він описує покоління вірусних квазівидів і спосіб вивести свої параметри, аналізуючи дані секвенування наступного покоління. Модель підтверджено на модельних даних, що показує перевага явно приймає процес рекомбінації до уваги, і проходять шляхом нанесення на читання, отримані з експериментальних зразків ВІЛ. До послуг гостей реалізацію алгоритму EM знайти максимальні оцінки апостеріорних параметрів моделі та метод оцінки розподілу вірусних штамів, в квазівидів

Вимоги :.

Java