Шпиндель альтернативний підхід для біологічної ідентифікації, заснованої на довжині рибосомальної РНК (рРНК) генів регіонів. Загалом, вирівнювання первинних послідовностей генів рРНК з різних видів показують чергуються галузі збереження нуклеотидной і варіації, як в плані нуклеотидних замін (зазвичай звані "ОНП") і вставки / видалення (INDEL) подій. Наявність вставкам результатів у послідовностями різної довжини і вводить прогалини в розстановці, як правило, позначається тире "-".
Наша концепція біологічної ідентифікації використовує послідовності генів рРНК наступним чином: консервативні регіони використовуються для визначення змінних сегментів ("Шпиндель гіперваріабельні області»), в якому поєднання послідовності довжин характеристика кожного виду ("шпиндель профілю"). Таким чином, кожен вид може бути визначений унікальним числовим профіль.
У теорії, огляд всього 6 гіперваріабельних областей з 20 алелей кожного (або 11 регіонів з 5 алелей кожного) достатньо, щоб дискримінаційними всіх еукаріотичних видів на Землі, які, за оцінками, від 5 до 15 млн в кількості. На практиці, шпиндель знаходиться в стані розрізняти 93,3% еукаріотичних видів з низьким внутрішньовидової мінливості і високої філогенетичного резолюції.
Коментар не знайдено