Swiss-PdbViewer (ака DeepView) є додаток, що надає дружній користувальницький інтерфейс, що дозволяє проаналізувати кілька білків, в той же час. Білки можуть бути накладені для того, щоб вивести структурні вирівнювання і порівняти їх активні сайти або будь-які інші відповідні деталі. Амінокислотних мутацій, Н-зв'язку, кути і відстані між атомами легко отримати завдяки інтуїтивним графічним і меню інтерфейсу.
Swiss-PdbViewer (ака DeepView) була розроблені з 1994 року Ніколя Guex. Swiss-PdbViewer тісно пов'язаний з SWISS-моделі, автоматизованої гомології моделювання сервері, розроблених в рамках Швейцарського інституту біоінформатики (SIB) в структурних біоінформатики групи на Biozentrum в Базелі.
Робота з цими двома програмами значно скорочує обсяг роботи, необхідної для створення моделі, як це можливо, щоб пронизувати білок первинну послідовність на 3D шаблону і отримати миттєвий зворотний зв'язок про те, як добре різьбленням білок буде прийнятий посилання структури перед відправкою запиту, щоб побудувати відсутні петлі і вдосконалити бічного ланцюга упаковки.
Swiss-PdbViewer також може читати карти електронної щільності, а також надає різні інструменти для створення в щільності. Крім того, різні інструменти моделювання об'єднані і командні файли для популярних пакетів мінімізації енергії можуть бути отримані.
Нарешті, в якості спеціального бонуса, POV-Ray сцени можуть бути отримані з поточного подання для того, щоб зробити приголомшливі Ray-простежується якість зображення.
Що нового У цьому випуску:
- атом тимін C6 тепер правильно завантажена
- Виправлений висновок нескінченний цикл POV-Ray на ПК-версії
- випадкове аварії при збереженні PDB файли (наприклад, 2i37) на ПК була встановлена
- Оновлене адресу Упсала Електронна щільність Карта сервера
Коментар не знайдено