FlexS

Flexs пророкує конформацию і орієнтацію одного з лігандів по відношенню до іншої. У Flexs посилання-ліганд, як передбачається, буде жорстким, таким чином, повинні бути приведені у конформації, яка схожа на зв'язаному стані. Алгоритм суперпозиції в Flexs потрібно тільки трохи ручного втручання. Ви можете інтегрувати ці знання в розрахунках з Flexs шляхом проведення окремі кроки вручну. Таким чином, Flexs призначений для інтерактивної роботи на лиганд пар, а також для лиганда на основі віртуального скринінгу. Два основних застосування Flexs є лиганд супер позиціонування (наприклад. Для CoMFA / QSAR) і віртуального скринінгу. Якщо у вас є білок і малу молекулу прив'язки до нього (так званий довідково-ліганд), але не структуру білка, ви можете взяти опорний структуру в якості негативного відбитку пальця активного сайту. Flexs визначає схожість між тестом і опорною структури, поєднавши їх. В віртуального скринінгу, у вас є референс-ліганд і набір з'єднань і ви зацікавлені в пріоритетності з'єднань для експериментальної перевірки.