Дані програми:
Версія: 4.1.0 оновлений
Дата завантаження: 10 Dec 15
Ліцензія: Безкоштовно
Популярність: 861
Це забезпечує аналітичні та статистичні процедури, аналізатори для поширених форматів файлів і дозволяє маніпуляції послідовності і 3D структур.
BioJava є інструментом для вивчення можливості Java в світі біоінформатики
Що нового У цьому випуску :.
- Відповідно протоколювання помилок. SLF4J використовується для реєстрації та надає адаптери для всіх основних реалізацій реєстрації.
- Покращена обробка винятків.
- Вилучені застарілі методи.
- Розширений підручник BioJava.
- Оновлені залежності, де це доречно.
- Доступно на Maven Central.
Що нового у версії 4.0.0:
- Consistent реєстрації помилок. SLF4J використовується для реєстрації та надає адаптери для всіх основних реалізацій реєстрації.
- Покращена обробка винятків.
- Вилучені застарілі методи.
- Розширений підручник BioJava.
- Оновлені залежності, де це доречно.
- Доступно на Maven Central.
Що нового у версії 3.1.0:
- Нові можливості:
- CE-CP версії 1.4, з додатковими параметрами
- Оновлення Сфера 2,04
- Покращення в FASTQ розбір
- виправити помилки в PDB розбір
- Невеликі виправлення в структурі угруповань
Що нового у версії 3.0.8:
- Нова
- GenBank, письменник
- Парсер для каріотип файлу з УСК
- Парсер для місць ген від УСК
- Парсер для назви генів файл з genenames.org
- модуль для регресії Кокса код для аналізу виживаності
- Розрахунок доступною площі поверхні (ASA)
- модуль для розбору файлів .OBO (онтології)
- Поліпшення:
- Подання SCOP і Берклі SCOP класифікацій
Що нового у версії 3.0.7:
- Додана основний аналізатор GenBank .
- Виправлена проблема при перекладі кодонів з N.
- Тепер можна зробити висновок облігацій на білкових структур.
- Додана підтримка для розбору mmcif записи для організму і системи експресії.
- Багато маленьких виправлень і поліпшень.
Що нового у версії 3.0.6:
- Розробка переїхав до GitHub за адресою: HTTPS: // github.com/biojava/biojava
Що нового у версії 3.0.5 :.
- Новий аналізатор для Кет класифікації
- Новий аналізатор для Стокгольмської форматі.
- Значно поліпшено уявлення біологічних зібрань білкових структур. Тепер можна заново створити біологічну збірку з асиметричною одиниці.
- Кілька виправлень помилок.
Що нового у версії 3.0.4:
- Це, головним чином, виправлена помилка випуск вирішенні питань у структура і розлад модулі білка.
- Однією з нових можливостей :. Дані SCOP тепер можуть бути або зверталися з оригінального сайту SCOP у Великобританії або версії Berkeley
Що нового у версії 3.0.3:
- Значні покращення в модулі веб-служби (NCBI вибух і HMMER веб-служби).
- & Quot; Новий & Quot; fastq парсер (портована із серії biojava 1 до версії 3).
- Підтримка просіює-PDB для відображення UniProt.
- модуль Protmod перейменований в modfinder.
Що нового у версії 3.0.2:
- структури білка: Покращена обробка білкових доменів: Тепер підтримує СКОП. Нова функціональність для автоматизованого прогнозування білкових доменів, на основі білка домену Parser.
- Невеликі поліпшення і виправлення в кількох інших модулів.
- biojava3-аа-проп: Цей новий модуль дозволяє розраховувати фізико хімічних та інших властивостей білкових послідовностей .
- biojava3 білка-безладдя: Новий модуль для прогнозування невпорядкованих областей в білках. Це засновано на реалізації Java провісника Ронн.
Що нового у версії 3.0.1:
- Реліз 3.0.1 в основному виправлення помилка звільнити для недавнього 3,0 опублікованому в якому міститься великий переписати в biojava коду.
Вимоги
- Java 1.6 або вище
Коментар не знайдено