CWC Simulator

Кхо Симулятор C ++ реалізація Кхо, обчислення для представлення та моделювання біологічних систем і NBSP ;. Після успішної установки (див INSTALL) ви зможете запускати симуляції більш Кхо моделей, як показано в деяких прикладах (див приклади /).
<Сильний> (командного рядка) Інтерфейс
У загальній користувачем, ви повинні запустити:

-i model.cwc
-o <Статистика>
-t <час>
-s
-n <працює>
-c <кластери>
--qt порога <порога>
-q <квантилі>
-w <працівники>
Де:
- є ім'я виконуваного файлу (за умовчанням: ScWc);
& NBSP; - model.cwc є введення Кхо програма (див приклади);
& NBSP; - статистика префікс виходу-файли;
& NBSP; - <час> є моделювання часу межа;
& NBSP; - є період дискретизації (тобто 0,12, щоб отримати 250 балів з терміну = 30);
& NBSP; - <працює> це кількість примірників моделювання;
& NBSP; - <кластери> є кількість кластерів К-засобів
& NBSP; - є поріг для QT кластеризації
& NBSP; - <квантилі> є число квантилів;
& NBSP; - <робочі> має, як правило, відповідно до кількості ядер вашої системи (тобто 4 для чотириядерного процесора).
<Сильний> Висновок
Інструмент виробляє:
- Деякі файли .dat (проби вихідні симуляцій)
- Деякі GNUPLOT скрипти залучити статистичні аналізи
Ми працюємо на докладне керівництво користувача

Особливості :.

• Алгоритм Гіллеспі SSA над Кхо моделей
• Гібридна стохастичною / детермінованих семантика
• Кілька примірників моделювання з онлайн-статистики
• Оптимізація для багатоядерних архітектур на основі рамках FastFlow
• розширюваний статистична база (маю на увазі дисперсія, фільтрують кластеризації і т.д.).
• Кілька рейтинг семантика (масова акція, Міхаеліс-Ментен, Хілл і т.д.).