кроків пакет для точного стохастичного моделювання систем реакції-дифузії в як завгодно складних 3D геометрії. Наш алгоритм ядро моделювання реалізація SSA Гіллеспі, продовжено мати справу з дифузії молекул за елементами 3D тетраедріческой сітці.
У той час як він був в основному розроблений для імітації детальних моделей нейронів сигнальних шляхів в дендритів і навколо синапсів, це загальний інструмент і може бути використаний для вивчення будь біохімічний шлях, в якому просторові градієнти і морфологія як вважають, відіграють певну роль.
Ми впровадили кроки як набір модулів Python, що означає кроку користувачі зможуть використовувати скрипти Python, щоб контролювати всі аспекти створення моделі, генерації сітки, керуючи моделювання та генерації та аналізу виробництва. Основні обчислювальні процедури все ще здійснюються у вигляді модулів розширення C / C ++ для максимальної швидкості виконання.
. КРОКИ розповсюджується під GPL v3 ліцензії
Вимоги
- Python
Коментар не знайдено