CLC DNA Workbench

CLC ДНК Workbench створює програмне середовище, що дозволяє користувачам зробити велику кількість передових послідовності ДНК аналіз, в поєднанні з гладкою управління даними, і відмінні графічні можливості перегляду і виводу.
CLC ДНК Workbench доступний на Windows, Mac OS X, Linux і платформ

Особливості :.

• Біоінформатика має в гені Workbench
• Гнучка перегляд кільцевих молекул.
• Редактор для графічного і алгоритмічно висунутої грунтовки дизайну
• Збірка даних послідовностей ДНК
• Молекулярне клонування
• Автоматичне SNP анотації послідовностей
• Пошук і виявлення закономірностей ДНК
• Локальна складність область аналізує
• Зворотній переклад з білком в гені, на основі таблиць перекладу з числа видів
• Розширений аналіз рестріктази та управління
• аналізи Dot Сюжет, заснований
• Статистика коротка форма ДНК в тому числі ряд характеристик даної молекули
• NCBI пошуку даних послідовність
• Доступ до веб-інформації з PubMed
• Інші функції біоінформатика:
• ДНК, РНК і редактор послідовність білка відображення лінійних і кільцевих молекул
• ДНК, РНК і білків редактор вирівнювання
• Інтерактивні логотипи вздовж обох ДНК, РНК і білків вирівнювання
• Пакетна обробка аналізів на декількох послідовностей в одному робочому кроку
• Пошук Мотив
• Відкриття шаблон (вказано моделі)

Опція вирівнювання
• Розширений повторно вирівнювання і виправити точкою
• Послідовність логотип графіки уздовж ДНК, РНК, білків і вирівнювання
• Керівництво анотації послідовностей
• пошук Комплексна PubMed
• Веб-пошук, використовуючи послідовність BLAST
• аналізи Dot Сюжет, заснований
• Локальна складність область аналізує і складності ділянки
• Gap фракція графіки
• G / C контент-аналіз і графіки
• Управління проектами та дані:
• Повна інтеграція введення даних, управління даними, результатами розрахунку, і експорт даних
• Детальний журнал історії
• Всі типи файлів можуть бути збережені в локальних проектів, і почав з програми
• Імпорт та експорт даних у великій кількості форматів файлів
• Можливість роботи в декількох активних робочих просторів одночасно, що дозволяє одночасно працювати з декількома проектами
• Імпорт файлів даних трасування і якості оцінки від автоматизованих машин sequening ДНК з використанням стандартних хроматограмме Формат, формати ABI і формат PHD (Phred)
• Перегляд і звітність:
• Розширений вигляд BLAST
• Розширений графіки дивитися
• Розширений вигляд гістограми
• Розширений вигляд точка ділянку
• Пошук характеристиками в послідовностях і вирівнювання

Вимоги

• 256 Мб оперативної пам'яті потрібно
• 512 Мб оперативної пам'яті рекомендується
• 1024 x 768 дисплей рекомендується

Обмеження

• 4-тижневий повністю функціональний демонстраційний