Jmol

Jmol - відкрите джерело, крос-платформне та вільне графічне програмне забезпечення, яке спочатку було розроблено як молекулярний переглядач для 3D-хімічних структур. Він працює в чотирьох автономних режимах, як веб-програма HTML5, програма Java, аплет Java і компонент на стороні сервера.

Основні функції включають високопродуктивну підтримку 3D-рендерингу, не вимагаючи будь-яких високотехнологічних апаратних засобів, експортує файли у формат JPG, PNG, GIF, PDF, WRL, OBJ та POV-Ray, підтримує основні блочні комірки, підтримує RasMol і Chime мови сценаріїв, а також бібліотека JavaScript.

Крім того, програмне забезпечення підтримує анімацію, поверхню, вібрацію, орбіталі, вимірювання, операції симетрії та операції з елементами, а також схематичні форми.

В даний час програма підтримує широкий діапазон форматів файлів, серед яких ми можемо згадати MOL MDL, V3000 MDL, SDF MDL, CTFile MDL, CIF, mmCIF, CML, PDB, XYZ, XYZ + vib, XYZ-FAH, MOL2, CSF, GAMESS, Гаус, MM1GP, HIN HIN / ВІЛ, MOLPRO та MOPAC.

Підтримує всі основні веб-переглядачі

Програмне забезпечення успішно протестовано всіма основними веб-переглядачами, зокрема Mozilla Firefox, Google Chrome, Internet Explorer, Opera і Safari. Вищезгадані додатки для браузера були протестовані на всіх основних операційних системах (див. Наступний розділ для підтримуваних ОС).

Будучи написаним на мові програмування Java, Jmol - незалежна від платформи програма, призначена для підтримки всіх дистрибутивів GNU / Linux, операційних систем Microsoft Windows і Mac OS X, а також інших ОС, де встановлено Java Runtime Environment.

Що нового у цьому випуску:

• виправлення помилки: Jmol SMILES, що не дозволяє шукати код вставки - додає & quot; ^ & quot; для коду вставки: [G # 129 ^ A. *]


• Виправлення помилки: Jmol SMILES, що не дозволяє шукати код вставки -

  Що нового - додає & quot; ^ & quot; для коду вставки: [G # 129 ^ A. *]

Що нового в версії 14.20.3:

• Виправлення помилки: Jmol SMILES, код пошуку - додає & quot; ^ & quot; для коду вставки: [G # 129 ^ A. *]

Що нового в версії 14.6.5:

• виправлення помилки: Jmol SMILES, що не дозволяє шукати код вставки - додає & quot; ^ & quot; для коду вставки: [G # 129 ^ A. *]

Що нового в версії 14.6.1:

• Виправлення помилки: Jmol SMILES, код пошуку - додає & quot; ^ & quot; для коду вставки: [G # 129 ^ A. *]

Що нового в версії 14.4.4 Build 2016.04.22:

• виправлено помилку: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.4 Build 2016.04.14:

• виправлено помилку: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.4 Build 2016.03.31:

• виправити помилку: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.3 Build 2016.03.02:

• виправлення помилок: анотації атомів встановлюються без наведених гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.3 Build 2016.02.28:

• виправлення помилок: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.2 Build 2016.02.05:

• виправлено помилку: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.4.0 Build 2015.12.02:

• виправлено помилку: не налаштовується для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.2.15:

• виправлення помилок: анотації атомів встановлюються не налаштовувані для додавання гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в версії 14.2.13:

• виправлено помилку: гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового у версії 14.2.12:

• виправлено помилку: гідрогенів
• виправлено помилку: 14.3.3_2014.08.02 розбив читач mmCIF
• виправлення помилки: читання BinaryDocument (спартанського файлу) зламане в 14.1.12_2014.03.18

Що нового в бета-версії 14.1.8:

• нова функція - встановити cartoonRibose:
• малює кільця рибози, з гранями, що показують збивання
• сполучається через C4'-C5'-O5'-P явно
• показує C3'-O3 "для довідки.
• вимикає мультиплікаційний фільтрBaseEdges (Edges Leontis-Westhof)
• відключений через SET cartoonBaseEdges ON
• запропонований Ріком Спінні, штат Огайо
• нова функція: рамка анімації [a, b, c, d] працює з негативними числами, щоб вказати діапазони:
• рамка анімації [1, -5, 10, -6] -> [1,2,3,4,5,10,9,8,7,6]
• читайте як "від 1 до 5, а потім від 10 до 6"
• нова функція: читач файлів Tinker (та оновлення FoldingXYZ читача):
• Можна використовувати Tinker ::, але це потрібно лише у випадку, якщо перша рядок є JUST атомом Count
• вміщує старий формат Tinker з n-1 атомами для atomCount
• дозволяє використовувати траєкторії та номер моделі
• нова функція: (фактично 13,1, але недокументована) кадр анімації [51 50 49 48 47 46 45 (і т.д.) 27 1 2 3 4 5 6 7 (і т.д.) ....]
• нова функція: x = порівняти ({atomomset1}, {atomset2}, & quot; MAP & quot;))
• нова функція: x = порівняти ({atomset1}, {atomset2}, & quot; MAP & quot ;, & quot; всі & quot;))
• нова функція: x = порівняти ({atomset1}, {atomset2}, & quot; MAP », & quot; найкраще & quot;)
• нова функція: x = порівняти ({atomomset1}, {atomset2}, & quot; MAP & quot ;, & quot; H »)
• нова функція: x = порівняти ({atomomset1}, {atomset2}, & quot; MAP & quot ;, & quot; allH & quot;)
• нова функція - x = порівняти ({atomomset1}, {atomset2}, & quot; MAP », & quot; кращийH»):
• генерує один або більше списків кореляцій на основі неароматичних SMILES
• додатково включає атоми Н
• додатково генерує всі можливі відображення атома
• повертає int [] [] = [[a1 b1], [a2 b2], [a3 b3], ...]
• де an та bn - це цілі чи індекси атомів, або список, коли "всі" вибір вибраний.
• наступна буде генерувати одну атомарну карту кореляції для двох структур, включаючи атоми водню: файли завантаження "a.mol" & quot; b.mol & quot; x = порівняти ({1.1} {2.1} & quot; MAP & quot; & quot; H) & quot;)
• Нижче наведено порівняння моделі кофеїну з NCI та системою PubChem:
• завантажити $ кофеїн; завантажити додати: кофеїн; кадр *
• виберіть 2.1; label% [atomIndex]
• порівняти {1.1} {2.1} SMILES rotate translate
• x = порівняти ({1.1}, {2.1}, & quot; MAP & quot ;, найкраще H »)
• для (a в x) {a1 = a [1]; a2 = a [2]; виберіть atomindex = a1; label @ a2}
• нова функція: порівняти {model1} {model2} SMILES:
• не потрібно давати SMILES; Jmol може генерувати його з {model1}
• нова функція: x = {*}. знайти (& quot; SMILES & quot ;, & quot; H & quot;):
• генерує SMILES з явними атомами H
• виправлення помилки: функція substructure () за допомогою SMILES замість SMARTS, тобто лише повні структури;
• Виправлено помилку: краще захоплення помилок та повідомлення в методах SMILES
• Виправлено помилку: зробіть webexport відкритим шлях до Jmol.jar та jsmol.zip більш надійним.
• виправлена ​​помилка: extractProperty extractModel не шанує підмножина
• виправлення помилки: встановити pdbGetHeader TRUE не фіксує REMARK3 REMARK290 REMARK350
• виправлення помилки: getProperty (& quot; JSON & quot ;, ....) слід загорнути значення у {value: ...}
• виправлення помилок: стійка прозорість MO переривається в 11.x
• виправити помилку: показати MENU написати MENU завантажити MENU всі зламані в 12.2
• виправити помилку: {*} [n] має бути порожнім, якщо nAtoms

Що нового у версії 14.0.7:

• Виправлена ​​помилка: 14.0.6 фатально жучки - unitcell і echo рендеринг, getProperty

Що нового в версії 14.0.5:

• Виправлення помилки: проривність LCAOCartoon зламана
• Виправлено помилку: напівпрозорий магістр зламаний
• Виправлена ​​помилка: розбиті читачі pqr, p2n
• Виправлення помилки: властивість xos із картою майна може вийти з ладу, якщо поверхня є фрагментом, який (як-небудь) має точку, яка не пов'язана з базовим атомом.

Що нового в версії 14.1.5 бета-версії:

• виправлено помилку: розірваність пропускання LCAOCartoon
• Виправлена ​​помилка: прозорий хребет зламаний
• Виправлена ​​помилка: розбиті читачі pqr, p2n
• виправлення помилок: властивість xos із картою майна може не скластись, якщо поверхня є фрагментом, який (як-небудь) має точку, яка не пов'язана з атомом, що лежить нижче.

Що нового в версії 14.0.4:

• Виправлена ​​помилка: розбиті ракети
• Виправлення помилки: PDB byChain, за допомогою Symop не підтримується.

Що нового в версії 14.0.2:

• виправлення помилки: модуляція не відрізняє q та t;
• виправлення помилок: модульні вимірювання не працюють
• виправити помилку: не пропускати встановити defaultLattice & quot; {NaN NaN NaN} & quot;
• виправлення помилок: не існує карта азоту з ізоповерхнею
• виправити помилку: вібраційний відображення модуляції з відстанями не оновлюється
• виправлення помилки: вибух призводить до непотрібного попередження в консолі
• виправлення помилок: розбити символ зламаний
• Виправлення помилки: array.mul (matrix3f) збій Jmol
• виправити помилку: виберіть symop = 1555 порушено
• виправлено помилку: встановити виділення dragSelected не працює
• код: рефаунований CifReader, що відокремлює коди MMCifReader та MSCifReader: незначні перейменування / рефакторинг методів у SV
• код: додає javajs.api.JSONEncodable інтерфейс
• надпроста реалізація в org.jmol.script.SV
• дозволяє реалізаціям javajs для доставки користувацьких результатів JSON

Що нового в бета-версії 14.1.2:

• нова функція: JavaScript: JSmol api Jmol.evaluateVar (аплет, вираз):
• краще, ніж Jmol.evaluate, тому що результат - це змінна JavaScript, а не рядок.
• ЗНИЖЕННЯ JSmol api Jmol.evaluate (аплет, вираз)
• нова функція: getProperty (& quot; JSON & quot ;, ....):
• повертає код JSON для ресурсу
• дозволяє JavaScript: x = Jmol.getPropertyAsArray (& quot; variableInfo & quot ;, & quot; деяке вираження & quot;)
• нова функція: getProperty variableInfo:
• дозволяє отримувати змінні в форматі Java або JSON
• оцінює вираз
• за промовчанням для & quot; все & quot;
• нова функція: модуляція регулюється q та t, до d = 3:
• включення / виключення модуляції (всі атоми)
• модулювання {атом встановлення} вмикання / вимикання
• модуляція int q-offset
• modulation x.x t-offset
• модуляція {t1 t2 t3}
• модуляція {q1 q2 q3} ІСТИНА
• нова функція: pickedList:
• замовлений масив нещодавно відібраних атомів
• можна використовувати те ж саме, що і змінну PICKED, але це призначено послідовно, а не тимчасово
• двічі натискання структури очищає список
• @ {pickedList} [0] останній вибраний атом
• @ {pickedList} [- 1] найближчий до останнього виділений атом
• @ {pickedList} [- 1] [0] останні два вибрані атоми
• нова функція: array.pop (), array.push () - аналогічно JavaScript
• нова функція: шкала модуляції x.x
• нова функція: заголовок & quot; xxxxx & quot; x.x - кількість секунд для запуску
• нова функція: модуляція 0.2 // встановлює t-значення
• нова функція: array.pop (), array.push (x)
• a = []; a.push (& quot; тестування & quot;); роздрукувати a.pop ()
• нова функція: виберіть ON / OFF атомний набір:
• вимикає або вимикає відлік гало, а також робить вибір
• лише зручність
• нова функція: pt1.mul3 (pt2):
• повертає {pt1.x * pt2.x, pt1.y * pt2.y, pt1.z * pt2.z}
• якщо обидва не є точками, повертається до простого множення
• new reature: array.mul3 (pt2) - застосовує mul3 до всіх елементів масиву
• нова функція: {atomset} .modulation (тип, t):
• забезпечує P3 (модуляція переміщення)
• реалізовано лише для типу = & quot; D & quot; (необов'язково)
• за бажанням t за замовчуванням
• виправлено помилку: модуляція не відрізняє q та t;
• виправлення помилок: модульні вимірювання не працюють
• виправити помилку: не пропускати встановити defaultLattice & quot; {NaN NaN NaN} & quot;
• виправлення помилок: несправний карта атомної орбіти не працює
• виправити помилку: вібраційний відображення модуляції з відстанями не оновлюється
• виправлення помилки: вибух призводить до непотрібного попередження в консолі
• виправлення помилок: розбити символ зламаний
• Виправлення помилки: array.mul (matrix3f) збій Jmol
• Виправлена ​​помилка: виберіть symop = 1555 зламаних Виправлена ​​помилка: набір вибір dragSelected не працює

<Літій> код: перероблений CifReader, відокремлюючи MMCifReader і MSCifReader
• код: незначне перейменування / рефакторінг методів у SV
• код: додає javajs.api.JSONEncodable інтерфейс:
• надпроста реалізація в org.jmol.script.SV
• дозволяє реалізаціям javajs для доставки користувацьких результатів JSON

Що нового у версії 14.0.1:

• нова функція: Jmol._j2sLoadMonitorOpacity (за замовчуванням 55)
• нова функція: функція завантаження (), як у завантаженні друку (& quot; xxx & quot;), обмежене читання локального файлу в аплеті:
• відсутні файли кореневих каталогів
• без файлів без розширення
• нема файлів з будь-яким & quot; /." на шляху
• нова функція: файли JAR надійно підписані
• нова функція: файли JAR-аплета включають JNLP (Java Network Launch Protocols) для завантаження локального файлу
• нова функція: параметри URL-адреси JSmol _USE = _JAR = _J2S = перевизначення для інформаційних даних
• нова функція: (була присутня, але недокументована) print quaternion ([масив quaternions]) - повертає сферичне значення a la Buss і Fillmore
• нова функція: print quaternion ([масив quaternions], true):
• повертає стандартне відхилення для сферичної середньої a la Buss і Fillmore
• одиниці - кутовий ступінь
• нова функція - названі значення модуля кватерніону:
• друкувати кватерніон (1,0,0,0)% "матрицю"
• параметри включають w x y z normal eulerzxz eulerzyz vector theta axisx axisz осьова матриця
• нова функція - встановіть celShadingPower:
• встановлює силу сигнал затінення
• цілі значення
• за замовчуванням 10 - товста лінія
• 5 - це тонка лінія
• 0 перетворює cel shading off
• негативне значення видаляє внутрішній затінення - лише контур
• діє на пікселях на основі нормального джерела світла (потужність> 0) або користувача (потужність <0)
• встановлює колір на фоновий контраст (чорний або білий), коли normal_z & lt; 1 - 2 ^ - (| celShadingPower | / 10)
• нова функція: звіти про читання mmCIF _citation.title в скриптовій консолі Jmol
• нова функція: мінімізувати SELECT {atomset} ТІЛЬКИ - ТІЛЬКИ параметр виключає всі інші атоми
• нова функція: мінімізувати {atomic} - неявно SELECT і ТІЛЬКИ
• нова функція - & quot; розширення & quot; Довідники в JSmol для написаних скриптів JS та SPT:
• jsmol / js / ext
• jsmol / spt / ext
• нова функція: завантаження ... фільтр & quot; ADDHYDROGENS & quot; - локальний набір pdbAddHydrogens для однієї команди завантаження
• нова функція: порівняти {1.1} {2.1} BONDS SMILES
• нова функція: list = compare ({atomomset1} {atomset2} & quot; SMILES & quot; & quot; BONDS & quot;)
• нова функція: напишіть JSON xxx.json
• нова функція: [# 210] читач JSON {& quot; моль & quot;: ...} читач
• нова функція - встановити particleRadius:
• глобальний радіус для атомів, що перевищує значення максимального радіуса (16,0)
• за замовчуванням до 20,0
• нова функція - фільтри CIF та PDB & quot; BYCHAIN ​​& quot; та & quot; BYSYMOP & quot; для випаровування:
• створює лише один атом на ланцюжок або на символ
• Розмір масштабу може бути більшим, ніж максимум 16 ангстрем, наприклад:
• встановити particleRadius 30;
• заповнення простору 30; // будь-яке число більше 16 років використовує particleRadius замість
• нова функція: list = compare ((atomomset1) (atomset2) SmartsString & quot; BONDS & quot;)
• нова функція: функція symop () дозволяє симетрії з фільтра біомолекули для PDB і mmCIF
• нова функція - isosurface SYMMETRY:
• застосовує оператори симетрії до ізорух
• більш ефективне візуалізація та створення
• вибір за замовчуванням є лише {symop = 1}
• За замовчуванням забарвлення полягає в тому, щоб колір за символом Symbol на основі властивості ColourScheme
• приклад:
• завантажуйте 1stp-фільтр "biomolecule 1"
• властивості кольору symop
• isosurface sa резолюція 0.8 симетрія sasurface 0
• нова функція - новий властивість атома: chainNo:
• послідовно з 1 для кожної моделі;
• chainNo == 0 означає "ланцюг без ланцюга" або chain = ''
• нова функція - нова властивість ColourScheme & quot; дружелюбно & quot;:
• колірна схема кольорової сліпоти
• використовується в RCSD
• нова функція: JSpecView повністю без Java; включає 2D nmr та PDF друк спектрів
• нова функція - WRITE PDF & quot; xxx.pdf & quot; якість & gt; 1 запит ландшафтного режиму:
• використовує ефективні класи створення PDF-файлів
• розмір зображення, якщо він є занадто великим
• нова функція: JSpecView додає PDF та 2D ЯМР для JavaScript
• нова функція: завантаження & quot; == xxx & quot; ФІЛЬТР & quot; NOIDEAL & quot; - завантаження хімічних компонентів з ПДБ, використовуючи "неідеальні" набір координат
• виправити помилку: записати CD вилучено; ChemDoodle змінив формат; використовуйте JSON замість
• виправлення помилок: у файлах PDB та CIF вказані збірки, такі як PAU, як велике негативне число
• Виправлено помилку: COMPARE, якщо без обертання починається нескінченний цикл
• виправлення помилки: проблема з циклом затримки (-1)
• Виправлено помилку: переміщення миші для Chrome в JavaScript
• виправлено помилку: виправлення спливаючого меню JavaScript для зміни мови
• Виправлено помилку: компоненти ядра JavaScript не обробляються; Jmol._debugCode не розпізнано
• виправлення помилки: некоректно компенсовано одиничне поле для біомолекул; Походження неправильне для осей.
• виправлення помилки: isosurface / mo FRONTONLY broken
• Виправлено помилку: локалізація мови порушена в JavaScript
• Виправлено помилку: читач ADF не читає вивід MO з DIRAC Build 201304052106
• виправлення помилки: Safari повідомляє про жовту інформацію Jmol, а не просить приймати аплет
• - тег повинен бути
• Виправлено помилку: CIF-читач не обробляє _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id правильно
• - неправильний атом встановлений для завантаження = 3fsx.cif фільтр & quot; ASSEMBLY 1 & quot;
• виправлено помилку: [# 558 Випуск сумісності з ChemDoodle] Помилка JSmol у визначенні номера .toString ()
• виправлено помилку: колесо миші не працює належним чином
• виправлення помилки: помилка компілятора JavaScript J2S не примушує int + = float до цілого
• виправлено помилку: варіант JavaScript WEBGL зламаний
• виправлено помилку: JavaScript NMRCalculation не має доступу до ресурсів
• виправлено помилку: стереозвук JavaScript не реалізовано
• виправлення помилок: виправлення для читання MOL для файлу з декількома моделями (всього 13.3.9_dev)
• виправити помилку: помилка читача MOL при завантаженні APPEND - не продовжує кількість атомів
• виправлення помилок: читач модуляції CIF не читає лінійні комбінації векторів клітинних хвиль
• виправити помилку: CIF-читання з фільтром & quot; BIOMOLECULE 1 & quot; не виконує лише операцію ідентифікації
• виправлено помилку: читач mmCIF не читає всі параметри _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
• виправлення помилок: запис PDB CRYST 1,0 1,0 1,0 90 90 90 повинен означати "не елементну клітинку" незалежно від біомолекулярного фільтра
• виправити помилку: ізорубкова плита добре не адаптується для плоских молекул, таких як HEM
• виправити помилку: друк userfunc () може вийти з ладу (userfunc () сам по собі добре)
• виправлено помилку: в межах (спіраль) не застосовується для полімерів із C-альфами
• виправлено помилку: _modelTitle не оновлюється, коли новий файл завантажується або закривається
• виправлено помилку: {*}. symop.all не доставляє оператора симетрії відповідним чином
• Виправлено помилку: для потрійного зв'язку в SMILES в URL-адресах
• виправлено помилку: build.xml відсутні класи створення PDF
• Виправлено помилку: слідує оновленню Java, додаючи правильний перевірку шляху для локального підписаного аплету
• виправлено помилку: {xxx} .property_xx не збережено в стані (зламані 8/7/2013 rev 18518)
• Виправлення помилки: продемонструє оновлення для підписних та непідписаних JAR-файлів додатка
• виправлено помилку: не вдається записати
• виправлена ​​помилка: скрипт скрипта Wait () зламаний
• виправлення помилки: сеанс PyMOL може відображати елементну комірку після прочитання зі збереженого стану
• виправлено помилку: читач MMCIF не працює для декількох типів зборів
• виправлення помилки: біометр CIF-читача "1" переклад "молекулярної" а не "збирання"
• Виправлено помилку: траєкторія завантаження з кількома файлами не працює
• виправлення помилки: спливаюче меню аплету JS не закривається належним чином після зміни мови
• виправлено помилку: атрибут ідентифікатора HTML-коду не присвоєно
• код: рефакторинг коду аплету / апплета; org.jmol.util.GenericApplet
• код: рефакторинг, спрощення буферних читачів та буферизовані вхідні потоки.
• код: рефакторинг JavaScript, краще будувати _... xml
• код: інтегрований JavaScript, довгий, короткий, байт, поплавковий, подвійний перероблений
• код: розбіжність GT ._
• code: рефакціонує всі зайві внутрішні класи до верхнього рівня
• код: isolated util / ModulationSet, використовуючи api / JmolModulationSet
• code - Вся локалізація мови аплету читається з простих файлів .po:
• як вже для JavaScript
• не потрібно збирати файли класів для мов аплетів
• немає мовних файлів .jar
• У новому каталозі jsmol / idioma зберігаються файли .po для Java і HTML5
• Код: швидше, що представляє собою візерунок, додаючи неявні "frontonly" & quot; з вибраним ТІЛЬКИ {xxx}
• код: швидше візуалізація ізосвіту з імпліцитною & quot; isosurfacepropertySmoothing FALSE & quot; у відповідних (цілих) випадках
• code: JmolBinary.getBufferedReaderForResource () - об'єднує всі посилання на URL.getContent () і Class.getResource ()
• код: JavaScript працюватиме для проблеми внутрішнього класу з перепризначенням змінної імені
• код: обхід для eval (functionName), який не працює в JavaScript.
• код: експериментувати з оклюзією навколишнього середовища
• код: необхідні маніфести, додані для Java Ju51 (січень 2014 р.).
• код: JmolOutputChannel перейшов до javajs.util.OutputChannel
• код: jsmol.php виправлено, щоб дозволити & quot; в методі SaveFile
• код: рефакторинг Parser в javajs.util
• код: DSSP перейшов до org.jmol.dssx, зменшивши біологічне навантаження JSmol на 20K
• код: пакет iText відправлений, більше не потрібен, тому що я написав свого власника PDF-файлу

Вимоги :

• Виконання середовища Oracle Java Standard Edition
22 Jun 18 в освітня та науково-програмне забезпечення, біоінформатика