MACS2 є модель, заснована інструмент аналізу для чіп-Seq даних.
З поліпшенням методів секвенування, хроматин иммунопреципитации з подальшим високою пропускною секвенування (чип-Seq) стає популярним для вивчення генома взаємодії білок-ДНК. Для вирішення проблеми нестачі потужний метод аналізу чип-Seq, ми представляємо новий алгоритм, названий Модель аналізу на основі чіпа-Seq (ГДК), для визначення фактора транскрипції сайти зв'язування. MACS захоплює вплив складності геному оцінити значимість збагачених ChIP регіонів, а MACS покращує просторову роздільну здатність сайти зв'язування за рахунок поєднання інформацію як секвенування положення міток і орієнтації. . MACS може бути легко використана для чіп-Seq даних поодинці, або з контрольним зразком із збільшенням специфіки
Вимоги
- Python
Коментар не знайдено