Genepidgin є набір Python інструментів, які допомагають в іменах продукції оцінки і генних призначення NBSP &; Є три основні компоненти .:genepidgin * очищувач *І NBSP; стандартизує Назви генів відповідності з керівними принципами іменування...
кроків пакет для точного стохастичного моделювання систем реакції-дифузії в як завгодно складних 3D геометрії. Наш алгоритм ядро моделювання реалізація SSA Гіллеспі, продовжено мати справу з дифузії молекул за елементами 3D тетраедріческой сітці.У той...
TRMiner є утиліта Python, яка спрямована на наукових кураторів даних і NBSP ;. Це дозволяє швидко обрізати великі збірники наукових публікацій, пропозицій, що мають відношення до даної гірської мети.Це досягається в два етапи. По-перше, тексти tranlated в...
Тест системи Біоінформатика є спроба побудувати розумну основу тестування, тести і дані, щоб кінцеві користувачі і постачальники, щоб дослідити продуктивність своїх систем.Те, що ми намагаємося зробити, це створити основу для тестування, і основний набір...
Штаден Пакет повністю розроблений набір збірки послідовності ДНК (Gap4), редагування та інструментів аналізу (спін) для Unix, Linux, MacOSX і MS Windows.На передній Gap4 було кілька дрібних приєднання пов'язаноїполіпшення в тому, як десятки...
АРЕМ буде заснований на MACS (моделі, заснованої аналізу для чіп-Seq даних).Висока пропускна секвенування з'єднаний з хроматину імуно опадів (чип-Seq) широко використовується для характеристики генома обов'язкових шаблонів транскрипційних...
seriesoftubes є розширена трубопровід для Solexa чип-Seq даних.Пакет документації Вимоги ...
MetagenomeDB це бібліотека Python розроблена легко зберігати, витягати і коментувати метагеномного послідовності і NBSP ;. MetagenomeDB виступати в якості рівня абстракції поверх бази даних MongoDB. Це забезпечує API для створення і редагування і...
Друк і модуль Python, який забезпечує вирівнювання послідовності на Hadoop.Друк і з MapReduce додаток для вирівнювання біологічного послідовності. Вона працює на Hadoop (http://hadoop.apache.org) через Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), в Python...
MISO (суміш изоформ) є ймовірнісної рамки написано в Python, що quantitates рівень експресії & NBSP; з альтернативного сплайсингу генів з РНК-Seq даних, і визначає диференційно регульованих ізоформи або екзонів за зразками.Шляхом моделювання генеративної...
